О неустойке

Подскажите, пожалуйста, если договором о выполнении работ предусмотрен окончательный расчет по факту выполненных работ, а исполнитель нарушил сроки их выполнения, могу ли я удержать при расчете сумму причитающейся неустойки или нужно рассчитаться по договору в полном объеме, а уже потом предъявлять претензию на выплату неустойки. В какое время такая претензия должна быть рассмотрена (ст.31 Закона на этот случай распространяется?) Какая ответственность за нарушение этих сроков? (ст.395 ГК РФ?)

Можете при расчёте предъявить "встречное требование" на основании ГК РФ:

Статья 328. Встречное исполнение обязательств
1. Встречным признается исполнение обязательства одной из сторон, которое в соответствии с договором обусловлено исполнением своих обязательств другой стороной.

Окончательный расчёт можно отложить на после согласия контрагента, после переговоров или после суда.

ГК РФ на сайте Гарант:
http://garant.ru/main/10064072-000.htm